Việc cắt tỉa cây mắc ca là rất quan trọng, bao gồm lợi ích như tăng năng suất, cải thiện chất lượng quả, và phòng ngừa sâu bệnh. Mục đích của việc cắt tỉa là chủ động điều tiết cành cấp 1-2-3, điều chỉnh khoảng cách phù hợp giữa các tầng cành, hạ thấp chiều cao cây, qua đó nâng cao chỉ số diện tích lá tối ưu, tạo cho tán thông thoáng, ánh sáng có thể chiếu vào trong tán, cây phát triển khỏe mạnh cân đối, hạn chế gãy đổ, tước cành, tạo thế tán cân bằng cho cây, đồng thời tạo điều kiện thuận lợi cho quá trình chăm và sóc hoạch. Ngoài ra tán mắc ca thông thoáng sẽ hạn chế sâu bệnh phát sinh phát triển, cành cấp 1-2 phát khỏe và bền vững, nâng cao hiệu suất quang hợp của bộ lá, cho năng suất chất lượng quả cao. Việc cắt tỉa tạo tán phải được thực hiện thường xuyên qua từng năm.
Mục đích chính của việc cắt tỉa là để nuôi dưỡng bộ khung phát triển hài hòa với 1 thân chính mạnh mẽ và 2,3 cành chính nhằm tạo ra 1 tán cây tròn và đều đặn.